农业部植物新品种测试（乌鲁木齐）分中心于2000年成立，挂靠新疆维吾尔自治区农业科学院。2005年农业部启动一期测试分中心建设项目，投资261万元，建成农业农村部植物新品种测试（乌鲁木齐）分中心测试基地，基地占地面积60亩，其中试验田45亩，实验室260平方米，仪器设备43台套，总价值约200万元。
2016年我国新《种子法》颁布实施，对品种管理的品种审定、品种登记和品种?；さ雀骰方诙家筇峁┨匾煨浴⒁恢滦院臀榷ㄐ圆馐员ǜ?。为了适应种业管理新形式，2017年乌鲁木齐分中心申报《农业部关于2018年现代种业提升工程》项目，获得批复（农计发[2017]194号文件），二期建设批复资金2204万元。
经两次建设，分中心基地现有测试试验田共计270亩。在院本部有实验室260平方米，各类试验仪器设备134台套，价值800余万元。测试能力达每年6000份，已知品种库保存能力达10万份。
