新疆特色果蔬基因组研究与遗传改良重点实验室依托于新疆维吾尔自治区农业科学院果蔬研究所，2021年12月由自治区科技厅批准建设。实验室主任是新疆维吾尔自治区农业科学院院长余庆辉研究员、实验室学术委员会主任是西北农林科技大学管清美教授。
实验室现有38人，其中研究人员35人，管理人员3人。其中正高级职称有13人，副高级职称有15人，中级职称3人，博士后6人。实验室面积合计为2050m2，仪器总值1601万元，其中十万元以上仪器设备37台（套）。
实验室面向国家农业可持续发展的重大战略需求和植物科学的国际发展前沿，围绕“新疆特色果蔬基因组研究及遗传改良”，开展系统性、原创性的基础和应用基础研究。引进德国慕尼黑工业大学、中国农业科学院、南京农业大学、西北农林科技大学等科研院校的优秀青年博士20名，柔性引进专家4名?；衽斐赜⒉帕炀瞬?人，青年博士项目10余项，国家自然科学基金3项，这些人才的加入显著提升了实验室的科研实力。
基础理论研究取得重大进展?！冻斗夯蜃檠芯拷沂疽吧驮耘喾盐镏只蜃楹徒峁贡湟於嘌浴肥状我缘谝坏ノ辉诠识ゼ镀诳禢ature genetics》发表；《MdNAC104通过CBF依赖及不依赖的多个途径协同增强苹果植株耐寒性》，在国际知名期刊《Plant biotechnology journal》发表，是目前新疆果树研究领域最高水平研究论文，为我国抗寒砧木及品种生物育种提供理论支撑。在国际知名期刊《Plant Biotechnology Journal》发表《通过全基因组分析和基因编辑上游开放阅读框提升番茄耐盐性》文章，该研究结果为在盐胁迫背景下通过基于uORF的策略和翻译调控增强遗传性状提供了新的视角和重要数据。通过视觉追踪了塑料微粒在无核白葡萄组织中的运输并评估其对葡萄生长的影响，该研究有望为葡萄面源污染暴露的风险评估提供科学依据。该研究成果“Visual observation of polystyrene nano-plastics in grape seedlings of Thompson Seedless and assessing their effects via transcriptomics and metabolomics”发表在国际权威期刊《Journal of Hazardous Materials》。
自有品种和技术支撑产业发展的能力不断加强。番茄“新红49号”，入选农业农村部2023年农业主导品种，也是此次我区唯一入选的农业主导品种，该品种是目前生产中推广面积最大的自主选育品种；系列加工番茄品种（系）合同转让金额495万元，本年度到位200万元?！拔率叶翰缋苯芳醴始跻┝⑻寮涮字帜Ｊ健比胙?023年自治区农业主推技术。
未来我们将继续深化新疆特色果蔬多组学研究，整合基因组、转录组及代谢组数据构建精准分子设计育种体系，开发高效基因编辑技术加速优异性状聚合；推动人工智能在组学大数据分析中的应用。同时深化与“一带一路”沿线国家的合作，推动研究成果向中亚干旱区辐射应用，服务区域农业可持续发展战略。
